Даже в лицензионной версии программы может появиться баг пипетки.
Вы тыкаете ей в фоновую картинку, но она не считывает оттенки.

Что делать:
1) Палитра - удалить дубликаты
2) Палитра - удалить неиспользуемые цвета
Пипетка должна начать работать, как положено.
